Отмечено, что как менопаузальные изменения, так и метаболические нарушения, особенно ожирение, усиливают дисбактериоз за счет снижения разнообразия микробиома как во влагалище, так и в кишечнике. При обоих состояниях также наблюдаются изменения эстроболома, что приводит к повышению системных уровней эстрогена, особенно после менопаузы. Кроме того, показано, что дисбиоз связан с системным воспалением в результате дефицита сигнальных Toll-подобных рецепторов и повышенной экспрессии провоспалительных цитокинов. Это состояние связывают с высоким риском онкологических заболеваний. Восстановление и поддержание нормальной микробиоты влагалища и кишечника в период менопаузы может быть стратегией профилактики рака репродуктивных органов у женщин.